Gealterter Whiskey hat den Großteil seiner chemischen Veränderungen während der Fassreifung durchlaufen. Er wurde oxidiert und kondensiert. Das Endprodukt ist im Allgemeinen stabil, jedoch wird mit der Zeit eine weitere Verdampfung von Flüssigkeiten auftreten, genau wie bei der Fassreifung, so dass eine Lagerung in luftdichten Behältern empfohlen wird.
Es ist bekannt, dass Sonnenlicht die Menge an Substanzen wie Hydroxymethlyfurfurale in gelagerten alkoholischen Getränken wie Met und Wein erhöht. Ich habe keine Studien gelesen, die in direktem Zusammenhang mit Whiskey stehen, aber da Restzucker vorhanden ist, scheint die Produktion wahrscheinlich, so dass eine Lagerung in Dunkelheit oder bei Nicht-UV-Licht wahrscheinlich ebenfalls positiv für eine langfristige Lagerung wäre.
Die Lagerstabilität von Whiskey, insbesondere wenn er versiegelt ist, wird die von Wein umgehen und bietet mit seinem hohen Ethanolgehalt eine der rauesten Umgebungen, in der sich jede Art von Verderbniserreger festsetzen kann, und ist zudem säurehaltiger als viele neutrale Liköre wie Wodka.